El Mercado Social de Madrid funciona internamente en base a criterios democráticos y participativos, y su organización interna está formada por cinco actores principales:

En primer lugar, las socias proveedoras y las socias consumidoras.

En segundo lugar, la Asamblea General anual, que está abierta a todas las socias proveedoras y socias consumidoras. En ella se toman las grandes decisiones estratégicas de la cooperativa y se elige al Consejo Rector de la misma.

En tercer lugar, el Consejo Rector de la cooperativa, que se reúne una vez al mes, y está formado por al menos una decena de representantes de las socias proveedoras y de las socias consumidoras. El Consejo Rector es el órgano de gobierno, de gestión general y de representación de la cooperativa.

En cuarto lugar, el Equipo Técnico, que lleva a cabo el trabajo del día a día de la cooperativa.

Por último, las Comisiones, que, abiertas a la participación de las socias proveedoras y las socias consumidoras, realizan su tarea alrededor de diferentes áreas de trabajo de la cooperativa (Acogida, Balance Social, Educación, Etics, Eventos, etc.), y en coordinación con el Equipo Técnico.

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